Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nme8Q715T0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms