Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR4

Ppp2r2b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ppp2r2bQ6ZWR4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms