Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Syne2Q6ZWQ0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms