Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RfflQ6ZQM0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RfflQ6ZQM0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms