Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Topbp1Q6ZQF0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms