Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp34Q6ZQ93 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp34Q6ZQ93 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms