Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
NinlQ6ZQ12 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NinlQ6ZQ12 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NinlQ6ZQ12 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms