Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ino80Q6ZPV2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ino80Q6ZPV2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms