Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smpd4Q6ZPR5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smpd4Q6ZPR5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smpd4Q6ZPR5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smpd4Q6ZPR5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smpd4Q6ZPR5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Smpd4Q6ZPR5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smpd4Q6ZPR5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smpd4Q6ZPR5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smpd4Q6ZPR5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smpd4Q6ZPR5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smpd4Q6ZPR5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smpd4Q6ZPR5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd4Q6ZPR5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms