Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ube2oQ6ZPJ3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2oQ6ZPJ3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms