Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc44a1Q6X893 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms