Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pcp4l1Q6W8Q3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pcp4l1Q6W8Q3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4l1Q6W8Q3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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