Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2eQ6VUP9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms