Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms