Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scgb2b2Q6UGQ3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scgb2b2Q6UGQ3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms