Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casc1Q6TDU8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Casc1Q6TDU8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms