Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shc4Q6S5L9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shc4Q6S5L9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms