Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip4Q6PHZ8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms