Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN9

Rab35, Ras-related protein Rab-35, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab35Q6PHN9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab35Q6PHN9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab35Q6PHN9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms