Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc46a1Q6PEM8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc46a1Q6PEM8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc46a1Q6PEM8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc46a1Q6PEM8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 785.1 ms