Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcc2Q6PDG5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcc2Q6PDG5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcc2Q6PDG5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms