Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rundc3bQ6PDC0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3bQ6PDC0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms