Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trak1Q6PD31 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trak1Q6PD31 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms