Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam222bQ6P539 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms