Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig8Q6P3A4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig8Q6P3A4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms