Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Slx4Q6P1D7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Slx4Q6P1D7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Slx4Q6P1D7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Slx4Q6P1D7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Slx4Q6P1D7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Slx4Q6P1D7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Slx4Q6P1D7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Slx4Q6P1D7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Slx4Q6P1D7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Slx4Q6P1D7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Slx4Q6P1D7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Slx4Q6P1D7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Slx4Q6P1D7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Slx4Q6P1D7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Slx4Q6P1D7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms