Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rprd2Q6NXI6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rprd2Q6NXI6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rprd2Q6NXI6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms