Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gpbp1Q6NXH3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gpbp1Q6NXH3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpbp1Q6NXH3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms