Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fndc3bQ6NWW9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc3bQ6NWW9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fndc3bQ6NWW9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms