Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms