Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTA4

Rragb, Ras-related GTP-binding protein B, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragbQ6NTA4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RragbQ6NTA4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RragbQ6NTA4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms