Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pdcd11Q6NS46 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pdcd11Q6NS46 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pdcd11Q6NS46 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms