Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltbQ6IRU5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CltbQ6IRU5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1213.1 ms