Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms