Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5416Q6IE28 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5416Q6IE28 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5416Q6IE28 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5416Q6IE28 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5416Q6IE28 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5416Q6IE28 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5416Q6IE28 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5416Q6IE28 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5416Q6IE28 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5416Q6IE28 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5416Q6IE28 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5416Q6IE28 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Gm5416Q6IE28 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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Gm5416Q6IE28 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5416Q6IE28 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5416Q6IE28 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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