Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6GQU0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6GQU0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6GQU0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6GQU0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6GQU0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Q6GQU0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6GQU0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6GQU0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6GQU0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6GQU0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6GQU0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6GQU0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6GQU0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6GQU0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q6GQU0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6GQU0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6GQU0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6GQU0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6GQU0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6GQU0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6GQU0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6GQU0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6GQU0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms