Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Carmil1Q6EDY6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Carmil1Q6EDY6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Carmil1Q6EDY6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms