Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK0

Prex1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex1Q69ZK0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prex1Q69ZK0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prex1Q69ZK0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms