Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp4Q68FH0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms