Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sptbn2Q68FG2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms