Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Fnip1Q68FD7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fnip1Q68FD7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms