Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgefl1Q68EF8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgefl1Q68EF8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgefl1Q68EF8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgefl1Q68EF8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgefl1Q68EF8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgefl1Q68EF8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgefl1Q68EF8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgefl1Q68EF8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgefl1Q68EF8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgefl1Q68EF8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgefl1Q68EF8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgefl1Q68EF8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgefl1Q68EF8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgefl1Q68EF8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rapgefl1Q68EF8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rapgefl1Q68EF8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms