Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nlrp4eQ66X19 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nlrp4eQ66X19 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms