Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms