Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms