Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Col4a5Q63ZW6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms