Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms