Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sp4Q62445 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp4Q62445 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms