Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff3Q62395 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff3Q62395 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms