Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt6hQ62383 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms